新冠肺炎全球確診超34萬、死亡超1.4萬。日前,Yann LeCun轉(zhuǎn)發(fā)推文:感染COVID-19會(huì)使你在一年內(nèi)的死亡幾率翻倍。危急時(shí)刻,世衛(wèi)組織對四種最有希望的新冠病毒治療方法展開全球大規(guī)模試驗(yàn),哥大數(shù)據(jù)科學(xué)研究所校友使用機(jī)器學(xué)習(xí)快速發(fā)現(xiàn)新冠病毒治療方法。
上周五,世界衛(wèi)生組織宣布了一項(xiàng)名為“SOLIDARITY”的大型全球性試驗(yàn),以尋找可以用于治療新冠肺炎的藥物。這項(xiàng)研究可能包括幾十個(gè)國家的數(shù)千名患者,盡可能設(shè)計(jì)的簡單,這樣即使是涌入了大量COVID-19患者的醫(yī)院也能參與進(jìn)來。
科學(xué)家建議了數(shù)十種現(xiàn)有化合物進(jìn)行測試,但世衛(wèi)組織正聚焦在四種它認(rèn)為最有希望的療法上:一種稱為瑞德西韋的實(shí)驗(yàn)性抗病毒化合物;瘧疾藥物氯喹和羥基氯喹;兩種艾滋病毒藥物的組合,洛匹那韋和利托那韋;洛匹那韋和利托那韋加上干擾素β。
關(guān)于COVID-19患者中使用這些藥物的一些數(shù)據(jù)已經(jīng)顯示,HIV聯(lián)合療法在中國的一項(xiàng)小規(guī)模研究中失敗了,但世衛(wèi)組織認(rèn)為,有必要對更多患者進(jìn)行大規(guī)模試驗(yàn)。
除了測試已有的潛在藥物,發(fā)現(xiàn)新的治療方法也很有必要。
哥大數(shù)據(jù)科學(xué)研究所(DSI)校友使用機(jī)器學(xué)習(xí)快速發(fā)現(xiàn)新冠病毒治療方法
哥倫比亞大學(xué)數(shù)據(jù)科學(xué)研究所(DSI)的兩名畢業(yè)生正在通過計(jì)算設(shè)計(jì)來快速發(fā)現(xiàn)冠狀病毒的治療方法。
Andrew Satz和Brett Averso分別是EVQLV的首席執(zhí)行官和首席技術(shù)官。EVQLV是一家初創(chuàng)公司,其創(chuàng)建的機(jī)器學(xué)習(xí)算法能夠在短短幾天內(nèi)識別并篩選數(shù)億種潛在的抗體治療方法,這遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了任何實(shí)驗(yàn)室的能力。在實(shí)驗(yàn)室中發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化抗體平均需要五年半的時(shí)間,而該算法只需一周的時(shí)間即可識別病毒抗體。
尋找抗體是發(fā)現(xiàn)新冠病毒療法的第一步。“我們的算法所要做的是減少實(shí)驗(yàn)室中藥物發(fā)現(xiàn)失敗的可能性。” Satz補(bǔ)充說:“我們盡可能在計(jì)算機(jī)模擬中試錯(cuò),以減少下游實(shí)驗(yàn)室發(fā)生錯(cuò)誤的可能性。這樣可以從繁瑣而費(fèi)時(shí)的工作中節(jié)省大量的時(shí)間?!?/FONT>
Brett Averso介紹道,EVQLV設(shè)計(jì)的一些抗體旨在防止冠狀病毒附著在人體上。“形狀正確的抗體與位于人細(xì)胞和冠狀病毒表面的蛋白質(zhì)結(jié)合,就像鎖和鑰匙的關(guān)系。這種結(jié)合可以防止病毒在人體中擴(kuò)散,從而可能限制疾病?!?/FONT>
EVQLV與專注于發(fā)現(xiàn)治療性抗體的公司Immunoprecise Antibodies(IPA)合作。EVQLV在發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化抗體后,將有希望的抗體基因序列發(fā)送給其實(shí)驗(yàn)室合作伙伴。然后,IPA將對最有希望的候選抗體進(jìn)行工程設(shè)計(jì)、制造和測試,該過程不再需要數(shù)年,而只需幾個(gè)月。成功的抗體將用于動(dòng)物研究,最后是人體研究。
考慮到國際上對抗冠狀病毒的緊迫性,Satz表示,有可能在2020年底之前為患者準(zhǔn)備好治療方案。
在就讀于DSI期間相識的Satz和Averso堅(jiān)定致力于“數(shù)據(jù)向善”。兩人在數(shù)據(jù)科學(xué)和醫(yī)療保健的交叉領(lǐng)域合作了多年,并于2019年12月成立了EVQLV,旨在使用AI技術(shù)來加快發(fā)現(xiàn)、發(fā)展和治愈健康問題的速度。該公司已經(jīng)發(fā)展到12名團(tuán)隊(duì)成員,技術(shù)涵蓋了機(jī)器學(xué)習(xí)和分子生物學(xué),軟件工程和抗體設(shè)計(jì),云計(jì)算以及臨床開發(fā)等領(lǐng)域。二人通常都每周工作100小時(shí),因?yàn)樗麄儗?shù)據(jù)科學(xué)充滿熱情,并致力于以此“幫助醫(yī)治有需要的人”。
Yann LeCun轉(zhuǎn)發(fā):感染COVID-19會(huì)使你在一年內(nèi)的死亡幾率翻倍
近日,DeepLearning大佬Yann LeCun在推特上轉(zhuǎn)了統(tǒng)計(jì)學(xué)家David Speigelhalter的一個(gè)推文并評論道:若感染了COVID-19,其死亡概率約等于一年內(nèi)任何其他原因的死亡概率。令人驚訝的是,無論年齡大小,都是如此。感染COVID-19會(huì)使你在一年內(nèi)的死亡幾率翻倍。
在Speigelhalter的博文中,他使用了英國國家統(tǒng)計(jì)局提供的生命表。由于先天性疾病和出生創(chuàng)傷,出生后有個(gè)死亡高峰,9、10歲是一個(gè)低谷,然后是穩(wěn)定的線性增長。不管年齡多大,每年死亡的人口比例都以9%左右的速度增長。所以平均死亡風(fēng)險(xiǎn)在8年內(nèi)翻倍。
國家統(tǒng)計(jì)局2016-2018年英格蘭和威爾士的年度死亡風(fēng)險(xiǎn)
倫敦帝國學(xué)院研究人員的最新報(bào)告提供了對新冠病毒感染后死亡的特定年齡段風(fēng)險(xiǎn)的估計(jì)值,這些風(fēng)險(xiǎn)如下表所示。
不同年齡組感染COVID-19后的死亡率
如果將感染COVID-19后的死亡率疊加在上面的“生命表”上(繪制每10年中的第7年),結(jié)果如下圖,可以看出,感染COVID-19后的死亡風(fēng)險(xiǎn)與正常死亡風(fēng)險(xiǎn)的趨勢是一致的。
然后,將COVID-19風(fēng)險(xiǎn)與生命表中的死亡風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行比較,得出相對風(fēng)險(xiǎn),范圍為0.5到2。
可以看出,感染COVID-19的死亡風(fēng)險(xiǎn)相當(dāng)于一年內(nèi)任何其他原因的死亡風(fēng)險(xiǎn)。用博主的話說“感染COVID-19就像將一年的風(fēng)險(xiǎn)打包到一兩個(gè)星期一樣”。
不過博主也指出,這兩個(gè)群體將會(huì)有很大的重疊——許多死于COVID-19的人無論如何都會(huì)在短時(shí)間內(nèi)死亡——因此這些風(fēng)險(xiǎn)不能簡單地加在一起,也不能簡單地將感染者的風(fēng)險(xiǎn)增加一倍。至關(guān)重要的是,國家醫(yī)療服務(wù)體系不能不堪重負(fù),但如果像現(xiàn)在所建議的那樣,通過嚴(yán)格的抑制措施,COVID死亡人數(shù)可以控制在20,000人左右,那么對2020年總體死亡率的影響可能很小(盡管由于衛(wèi)生服務(wù)的壓力和隔離的副作用,基礎(chǔ)死亡率可能會(huì)增加)。不過,正如我們所看到的,代價(jià)是巨大的。(來源:新智元)
參考鏈接:
https://medium.com/wintoncentre/how-much-normal-risk-does-covid-represent-4539118e1196
https://www.technology.org/2020/03/22/dsi-alumni-use-machine-learning-to-discover-coronavirus-treatments/
(轉(zhuǎn)載)